2025-05-28 06:09:45
轉錄組測序結果及TCGA數據庫分析)圖5RNA-Seq和m6A-seq聯(lián)合鑒定SOCS2是介導的m6A修飾的下游靶基因PLoSOne2015,在許多不同種類(lèi)的RNA中,都已觀(guān)察到N6-腺苷(m6A)的甲基化,但其在microRNAs中還沒(méi)有被研究。研究者在FTO1C1,FTO2D4和FTO3C3細胞系中,通過(guò)敲除m6A甲基轉移酶FTO篩選到表達差異的microRNA,說(shuō)明miRNA受m6A甲基化的調控。進(jìn)一步通過(guò)MeRIP-Seq發(fā)現相當一部分的microRNA具有m6A修飾。通過(guò)motif分析,他們發(fā)現了區分甲基化和非甲基化microRNA的一致序列。該文章所述的表觀(guān)遺傳修飾在基因表達的轉錄調控的復雜性上增加了一個(gè)新的層次。圖FTO敲除對甲基化的miRNAs的穩定狀態(tài)的影響。參考文獻Y,DominissiniD,RechaviG,HeC:Geneexpressionregulationmediatedthroughreversiblem(6)(5):(1):(12):(6):(1):(1):(uridine)(41):(6)(7540):(1):(7481):(4):(6)A-LAIC-seqrevealsthecensusandcomplexityofthem(6)(8):UTRm(6)(4):(7544):(6)(6):(5):(7667):(2):"">pan>xiainducesthebreastcancerstemcellphenotypebyHIF-dependentandALKBH5-mediatedm(6)(14):"">pan>(40):(6)(3):(1):(1):(4):(11):。維持細胞內外環(huán)境的穩定。細胞質(zhì)是細胞內的液體,其中包含了各種細胞器和細胞骨架等結構。上海模式科研技術(shù)服務(wù)培養
在人類(lèi)疾病研究中數據表明,常用實(shí)驗動(dòng)物模型按產(chǎn)生原因分為以下5類(lèi):自發(fā)性動(dòng)物模型、誘發(fā)型動(dòng)物模型、遺傳工程動(dòng)物模型、生物醫學(xué)動(dòng)物模型和陰性動(dòng)物模型。下面上海研錄帶大家一起看看吧:1、自發(fā)性動(dòng)物模型:是指動(dòng)物未經(jīng)任何有意識的人工處理,在自然條件下或基因突變條件下所產(chǎn)生的疾病模型。主要包括突變型的遺傳病模型和近郊系的疾病模型。2、誘發(fā)型動(dòng)物模型:亦稱(chēng)實(shí)驗性動(dòng)物模型。是使用物理、化學(xué)或生物致病因素誘導動(dòng)物產(chǎn)生某些類(lèi)似人類(lèi)疾病表現而制備的動(dòng)物模型。此模型具有制備方法簡(jiǎn)單,實(shí)驗條件容易控制,重復性好等特點(diǎn),廣泛應用于藥物篩選、毒理、傳染病、病理機制的研究。3、遺傳工程動(dòng)物模型:是利用遺傳工程技術(shù)對動(dòng)物基因組進(jìn)行修飾,用于研究基因功能或疾病機制的動(dòng)物模型。也稱(chēng)基因修飾動(dòng)物模型,是指利用胚胎工程和基因工程等生物技術(shù)有目的的干預動(dòng)物的遺傳組成,導致動(dòng)物出現新的性狀,并使其能夠有效地遺傳下去,形成新的可供生命科學(xué)研究的和其他目的所用的動(dòng)物模型。4、生物醫學(xué)動(dòng)物模型:也是指利用健康生物的特定生物學(xué)特征,研究人類(lèi)疾病相似表現得模型。這類(lèi)動(dòng)物模型與人類(lèi)疾病存在一定的差異,研究者應加以比較,從中獲得有關(guān)材料。上海兔科研技術(shù)服務(wù)購買(mǎi)由于大部分研究使用到的是人類(lèi)來(lái)源的細胞,種植到免疫正常的動(dòng)物體內會(huì )發(fā)生免疫排斥反應。
RNA各種可逆的化學(xué)修飾被認為是一種新的表觀(guān)遺傳調控方式。m6A是真核生物mRNA常見(jiàn)的化學(xué)修飾,在調控mRNA穩定性,剪切和翻譯方面具有重要的作用。作者使用轉錄組測序發(fā)現了METTL3(甲基轉移酶3),一種主要的RNAN6-腺苷-甲基轉移酶,在人肝細胞(HCC)和多種實(shí)體中高表達。在臨床上,METTL3的過(guò)度表達與肝細胞患者不良預有關(guān)。體外實(shí)驗證明敲除METTL3會(huì )抑制HCC細胞增殖,遷移及克隆形成。體內實(shí)驗證明敲除METTL3會(huì )明顯抑制HCC體內成瘤和肺轉移。另外,使用CRISPR/dCas9-VP64系統,內源性高表達METTL3會(huì )促進(jìn)HCC細胞在體外和體內生長(cháng)。通過(guò)轉錄組測序、m6A-Seq、MeRIP-PCR,作者確定了SOCS2(細胞因子信號2的抑制因子)作為METTL3介導的m6A修飾的下游靶基因。敲除METTL3表達會(huì )消除SOCS2mRNAm6A修飾并增強SOCS2mRNA表達。m6A介導的SOCS2mRNA降解是依賴(lài)于m6A“讀取器”蛋白YTHDF2??傊?,METTL3在HCC大部分高表達中,并通過(guò)m6A-YTHDF2依賴(lài)機制抑制SOCS2表達從而促進(jìn)HCC進(jìn)展。因此,作者發(fā)現了在肝發(fā)生過(guò)程中表觀(guān)遺傳改變的一種新機制。圖4RNA甲基化轉移酶METLLT3在肝組織中高表達。
保存于嚴密緊塞或加蓋的容器里,同時(shí)在容器外上標簽,并隨同材料在溶液中投入相應的標簽,以免相互混淆。標簽上注明固定液、材料來(lái)源、日期等。標簽上的文字,應用黑色鉛筆或繪圖黑墨水書(shū)寫(xiě)。3.脫水注意事項(1)脫水原理:乙醇與石蠟不相溶,而二甲苯既能溶于乙醇又能溶于石蠟。當組織中全部被二甲苯占有時(shí),光線(xiàn)可以透過(guò),組織呈現出不同程度的透明狀態(tài)。(2)脫水必須在有蓋的玻璃品中進(jìn)行,防止吸收空氣中的水分。(3)在更換高一級的脫水劑時(shí),不要移動(dòng)材料以免損壞,可用吸管吸出器皿中的脫水劑,再用吸水吸盡器皿內剩余液,然后于皿中加入高一級脫水劑。(4)在低濃度酒精中,每級停留不宜太長(cháng),否則易使組織變軟,助長(cháng)材料的解體。(5)在高濃度或純酒精中,每級停留的時(shí)間也不宜太長(cháng),否則會(huì )使組織變脆,影響切片。(6)如需過(guò)夜,應停留在70%酒精中。(7)脫水必須徹底,否則不易透明,甚至使透明劑內出現白色混濁現象。4.透明注意事項(1)使用透明劑時(shí),要隨時(shí)蓋緊蓋子,以免空氣中的水分進(jìn)入。(2)更換每級透明劑,動(dòng)作要迅速,一方面為了不使材料塊干涸,另一方面能避免吸收濕氣。(3)在透明過(guò)程中,如果材料周?chē)霈F白色霧狀,說(shuō)明材料中的水未被脫凈。通過(guò)不同分組之間的細胞對于劃痕區修復能力的不同,可以判斷各組細胞的遷移與修復能力的差別。
用伊紅乙醇液對比染色1~3min。(4)將切片放入95%乙醇中洗去多余的紅色,然后放入無(wú)水乙醇中3~5min,吸干后將切片放入二甲苯Ⅰ、Ⅱ中各3~5min。3、觀(guān)察在鏡下可見(jiàn)卵巢呈扁橢圓形,表面為單層扁平上皮細胞或單層立方上皮,卵巢實(shí)質(zhì)分為皮質(zhì)和髓質(zhì)??梢?jiàn)上皮,原始卵泡和生長(cháng)卵泡。卵巢組織中各發(fā)育階段卵泡及卵巢基質(zhì)的形態(tài)結構清晰可見(jiàn),細胞核呈藍紫色,細胞質(zhì)及間質(zhì)成分呈淺紅色,卵泡中卵母細胞、卵泡細胞、透明帶均清晰可見(jiàn)。注意事項1.取材注意事項(1)取材動(dòng)作要迅速,不宜作太久的拖延以免組織細胞的成分、結構等發(fā)生變化。(2)切片材料應根據需要觀(guān)察的部位進(jìn)行選擇,盡可能不要損傷所需要的部分。(3)切取的組織塊不宜太大,以利于固定劑穿透,通常以5mmx5mmx2mm或10mmx10mmx2mm為宜。2.固定注意事項(1)一般固定液,都以新配為好,配好后應貯存在陰涼處,不宜放在日光下,以免引起化學(xué)變化,失去固定作用。(2)有些混合固定液的成份之間會(huì )發(fā)生氧化還原作用,一定要在使用前才混合,如果混合太早,固定時(shí)就沒(méi)有作用了。(3)固定材料時(shí),固定液必須充足,一般為材料塊的20~30倍,有些水分多的材料,中間應更換1~2次新液。(4)材料固定完畢后。細胞培養板的選購要注意哪些?上海模式科研技術(shù)服務(wù)培養
動(dòng)物疾病模型是一種用于研究人類(lèi)疾病的重要工具。上海模式科研技術(shù)服務(wù)培養
建議按照2×106每孔的數量將293T細胞均勻鋪入。(2)第二天:在24小時(shí)之內,觀(guān)察293T細胞的匯合度在90%~95%之間時(shí),向其中加入DNA-脂質(zhì)體復合體,DNA-脂質(zhì)體復合體制備方法如下:a)輕輕混勻LipoMax,根據說(shuō)明書(shū)加入相應量于500?lOpti-MEM無(wú)血清培養基中,混合均勻并置于室溫5分鐘。b)在500?lOpti-MEM無(wú)血清培養基中稀釋DNA,總質(zhì)量為15?g按照載體質(zhì)粒:psPAX2:=4:3:1的比例加入DNA。c)將稀釋后的LipoMax和稀釋后的DNA輕輕混勻,常溫靜置20分鐘,形成DNA-LipoMax復合體。(3)將DNA-LipoMax復合體輕柔地滴加至細胞培養皿中,輕輕搖晃培養皿混勻,放入細胞培養箱中培養。(4)病毒收集濃縮病毒:加入DNA-LipoMax復合體48小時(shí)后,收集病毒上清,同時(shí)加入10ml預溫的293T培養基到細胞培養皿中。將收集到的病毒上清存在4℃冰箱中;收集72小時(shí)病毒上清,與48小時(shí)病毒上清混在一起。將離心機溫度降溫到4℃,600g,離心5分鐘,去除其中的細胞碎片,上清液經(jīng)?m濾頭過(guò)濾,加入病毒濃縮液,配制濃縮病毒液。將濃縮后的病毒放于4℃冰箱搖床上,旋轉過(guò)夜。第二天,4度離心機,3000~4000g離心15分鐘。棄掉上清液,加入1Xpbs或培養基重懸。上海模式科研技術(shù)服務(wù)培養